阿里云智能達摩院-新冠肺炎全基因組測序智能分析

解決方案及特色

基因組檢測需要做到快速準確，對海量測序數(shù)據(jù)做到快速分析需要強大的計算和存儲系統(tǒng)。依托阿里云強大的云平臺，支持線上和本地化大數(shù)據(jù)套件部署。
基因組數(shù)據(jù)分析方面，主要提供并行、分布式的大數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)。功能包括序列質(zhì)控、序列比對、序列拼接。每個步驟經(jīng)過優(yōu)化設(shè)計和參數(shù)調(diào)優(yōu)使得對于 CPU 和內(nèi)存的利用更為高效，從而有效減少了數(shù)據(jù)分析的時間。此外，系統(tǒng)提供友好界面，并支持一鍵出分析報告功能。
除了病原體檢測之外，對于不同來源病原體的序列和結(jié)構(gòu)分析有助于實現(xiàn)病原體的朔源和對應(yīng)藥物分析。進化分析以及基于深度學(xué)習(xí)的人工智能算法能夠加速并且精準實現(xiàn)預(yù)期目的。
系統(tǒng)采用云架構(gòu)，支持線上和用戶本地部署。配合阿里云專有云的 Iaas 和 Paas 系統(tǒng)，快速搭建大數(shù)據(jù)平臺。該平臺采用分布式存儲和分布式計算系統(tǒng)，有效解決基因測序數(shù)據(jù)量大，分析計算需要分布式或并行方式的特點。基于該大數(shù)據(jù)平臺，分析速度能有效提升 4~10 倍，人工智能分析處理速度也大幅提升。

應(yīng)用與效果

全基因組測序技術(shù)在全國進行應(yīng)用實踐。阿里達摩院在浙江省疾控中心和武漢金銀潭醫(yī)院做試點應(yīng)用，效果不錯，整體準確率非常高。